ОЦР системи подржавају отпремање датотека у више формата тако да корисници могу флексибилно да конвертују документе из различитих извора у текст који се може уређивати. Следе неки уобичајени формати датотека које ОЦР системи могу да подржавају:
Формат слике:
ЈПЕГ/ЈПГ: Широко коришћени формат компресије слике погодан за фотографије и скениране документе.
ПНГ: Формат компримоване слике без губитака који подржава транспарентност и обично се користи за веб слике и иконе.
ТИФФ/ТИФ (укључујући ТИФФ са више страница): висококвалитетни формат слике који се обично користи у штампарској и издавачкој индустрији и подржава документе са више страница.
БМП: Стандардни формат слике у Виндовс системима који није компресован, има висок квалитет али велике величине датотека.
ГИФ: Формат слике који подржава анимацију и транспарентност. Иако се углавном користи за веб слике, ОЦР системи га такође могу подржавати.
Формат документа:
ПДФ: преносиви формат документа који се широко користи за дељење и штампање докумената као што су е-књиге, извештаји и уговори. ОЦР системи су обично у стању да препознају скенирани текст у ПДФ датотекама.
Иако су ОЦР системи у стању да обрађују датотеке у више формата, датотеке у различитим форматима могу имати различите ефекте препознавања током ОЦР процеса. На пример, ТИФФ датотеке са високим квалитетом скенирања и јасним сликама обично су лакше за прецизно препознавање од ЈПЕГ датотека. Стога, када бирају за отпремање датотека, корисници би требало да бирају на основу својих потреба и квалитета датотеке.